Virus Corona
Mengenal Apa Itu WGS, Whole Genome Sequencing, untuk Hadapi Omicron: Pengertian dan Cara Kerjanya
Mengenal apa itu WGS: berikut pengertian, cara kerja serta manfaat yang akan diperoleh
Penulis:
Faishal Arkan
Editor:
Pravitri Retno W
Cara Kerja WGS
Para ilmuwan melakukan pengurutan seluruh genom dengan mengikuti empat langkah utama ini, yakni:
1. Pemotongan DNA
Para ilmuwan menggunakan gunting molekuler untuk memotong DNA, yang terdiri dari jutaan basa: A, C, T, dan G, menjadi potongan-potongan yang cukup kecil, yang selanjutnya dapat terbaca oleh mesin pengurutan.
2. Pengodean batang DNA
Para ilmuwan menambahkan potongan kecil tag DNA, atau kode batang, guna mengidentifikasi potongan DNA mana yang dimiliki bakteri mana.
Hal tersebut mirip dengan bagaimana kode batang mengidentifikasi produk di sebuah toko kelontong.
3. Sekuensing seluruh genom
DNA berkode batang dari banyak bakteri digabungkan dan dimasukkan ke dalam sekuenser genom secara keseluruhan.
Sequencer mengidentifikasi basa A, C, T, dan G, yang membentuk setiap urutan bakteri.
Sequencer menggunakan kode batang untuk melacak basis mana yang dimiliki bakteri mana.
4. Analisis data
Para ilmuwan menggunakan alat analisis komputer untuk membandingkan urutan bakteri dan mengidentifikasi perbedaan.
Jumlah perbedaan tersebut dapat memberi tahu para ilmuwan seberapa dekat hubungan bakteri itu, dan seberapa besar kemungkinan menjadi bagian dari wabah yang sama.
Cara WGS Mengidentifikasi Penyakit