Mengenal Apa Itu WGS, Whole Genome Sequencing, untuk Hadapi Omicron: Pengertian dan Cara Kerjanya

WGS memberikan data yang lebih rinci dan tepat untuk mengidentifikasi wabah daripada teknik standar saat ini yang digunakan PulseNet, elektroforesis gel bidang-berpulsa (PFGE).

Alih-alih hanya memiliki kemampuan untuk membandingkan genom bakteri menggunakan 15-30 pita yang muncul dalam pola PFGE, WGS memiliki jutaan basis untuk dibandingkan.

Dengan menggunakan pengurutan seluruh genom, WGS dapat menemukan beberapa bakteri yang tampak berbeda memakai PFGE sebenarnya berasal dari sumber yang sama.

Hal tersebut telah membantu menyelesaikan beberapa wabah penyakit lebih cepat.

WGS merupakan cara yang cepat dan terjangkau untuk mendapatkan informasi tingkat tinggi tentang bakteri hanya dengan satu tes.

Saat ini, proses untuk mengarakterisasi bakteri sepenuhnya membutuhkan dua atau lebih ilmuwan untuk melakukan empat atau lebih tes terpisah termasuk PFGE.

WGS akan sangat meningkatkan efisiensi cara PulseNet melakukan pengawasan.

PulseNet secara aktif memvalidasi teknologi next-generation sequencing (NGS) serta mengembangkan, mengevaluasi, dan mengimplementasikan alat yang diperlukan untuk menganalisis data.

Keuntungan Metode WGS

Pada laman illumina.com, dijelaskan keuntungan menggunakan metode WGS, yakni:

- Memberikan tampilan genom dengan resolusi tinggi;

- Menangkap varian besar dan kecil yang mungkin terlewatkan dengan pendekatan yang dilakukan;

- Mengidentifikasi varian penyebab potensial untuk studi tindak lanjut lebih lanjut dari ekspresi gen dan mekanisme regulasi;

- Memberikan volume data yang besar dalam waktu singkat untuk mendukung perakitan genom baru.

Baca juga: 2 Orang Positif Omicron usai Pulang dari Amerika dan Inggris, Satgas Covid-19 Fokus Lakukan Tracing

(Tribunnews.com/Arkan) (Kompas.com/Retia Kartika Devi)

Berita lainnya seputar penanganan Covid